Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajb6O54946 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms