Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms