Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms