Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NudcO35685 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NudcO35685 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NudcO35685 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NudcO35685 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NudcO35685 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NudcO35685 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NudcO35685 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NudcO35685 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms