Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms