Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms