Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Casq1O09165 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Casq1O09165 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Casq1O09165 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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