Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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