Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms