Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms