Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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