Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4340L7N2C4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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