Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms