Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm2035J3QP87 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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