Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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