Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms