Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms