Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tmem200cJ3QK46 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem200cJ3QK46 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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