Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp17lcG5E8I7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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