Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms