Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 960 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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