Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm15455-201ENSMUST00000117459 2557 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm10408-201ENSMUST00000096168 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Lrrc2-201ENSMUST00000035076 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20604F8WIA3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms