Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp32F8VPZ3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp32F8VPZ3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp32F8VPZ3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms