Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3371F7CQW8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3371F7CQW8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3371F7CQW8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3371F7CQW8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3371F7CQW8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms