Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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