Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms