Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms