Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb3D3Z6J4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms