Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3543D3Z235 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms