Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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