Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms