Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp42B2RQC2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp42B2RQC2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp42B2RQC2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp42B2RQC2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp42B2RQC2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp42B2RQC2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp42B2RQC2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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