Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prr29B1ARI9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr29B1ARI9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms