Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttll11A4Q9F4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttll11A4Q9F4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttll11A4Q9F4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms