Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Catsper2A2ARP9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper2A2ARP9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms