Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rtf1A2AQ19 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rtf1A2AQ19 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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