Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc183A2AJB1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc183A2AJB1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc183A2AJB1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc183A2AJB1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc183A2AJB1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc183A2AJB1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc183A2AJB1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc183A2AJB1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms