Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VirmaA2AIV2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms