Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm5538W4VSP6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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