Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Top3bQ9Z321 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Top3bQ9Z321 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms