Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mbd1Q9Z2E2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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