Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms