Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms