Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clcf1Q9QZM3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms