Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms