Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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