Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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