Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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