Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap3b2Q9JME5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms