Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms